MiR-15b-5p Promotes Growth and Metastasis of Renal Clear Cell Carcinoma / MiR-15b-5p Promueve el Crecimiento y la Metástasis del Carcinoma Renal de Células Claras

SUMMARY: We investigated the expression and clinical significance of miR-15b-5p in clear cell renal cell carcinoma (RCC) through bioinformatics analysis and experimental verification. The differentially expressed miRNAs were screened in the GEO database. Venn diagram showed that there were 5 up-regulated miRNAs (has-miR-210, has-miR-142-3p, has-miR-142-5p, has-miR-15b-5p, and has-miR-193a-3p) and only 1 down-regulated miRNA (has-miR-532-3p) that were commonly expressed between GSE189331 and GSE16441 datasets. This was further confirmed in TCGA. Further analysis showed that the has-miR-193a-3p, has-miR-142-3p, has- miR-142-5p, and has-miR-15b-5p were closely related to tumor invasion, distant metastasis and survival probability. The expression of miR-15b-5p in ccRCC tissues was significantly higher than that in adjacent normal kidney tissues (P0.05). Following inhibition of miR-15b-5p expression, RCC cells had attenuated proliferation, increased apoptosis, and attenuated migration and invasion. has-miR-15b-5p-WEE1, has-miR-15b-5p-EIF4E, has-miR-15b-5p-PPP2R1B may be three potential regulatory pathways in ccRCC. miR-15b-5p is highly expressed in cancer tissues of ccRCC patients. It may promote proliferation, inhibit apoptosis and enhance cell migration and invasion of RCC cells. The has-miR-15b-5p-WEE1, has-miR-15b-5p-EIF4E, and has-miR-15b-5p-PPP2R1B may be three potential regulatory pathways in ccRCC.

Investigamos la expresión y la importancia clínica de miR-15b-5p en el carcinoma de células renales (CCR) de células claras mediante análisis bioinformático y verificación experimental. Los miARN expresados diferencialmente se examinaron en la base de datos GEO. El diagrama de Venn mostró que había 5 miARN regulados positivamente (has-miR-210, has-miR-142-3p, has-miR-142-5p, has-miR-15b-5p y has-miR-193a-3p). ) y solo 1 miARN regulado negativamente (has-miR-532-3p) que se expresaron comúnmente entre los conjuntos de datos GSE189331 y GSE16441. Esto fue confirmado aún más en TCGA. Un análisis más detallado mostró que has-miR-193a-3p, has-miR-142-3p, has- miR-142-5p y has-miR-15b-5p estaban estrechamente relacionados con la invasión tumoral, la metástasis a distancia y la probabilidad de supervivencia. La expresión de miR-15b-5p en tejidos ccRCC fue significativamente mayor que la de los tejidos renales normales adyacentes (P 0,05). Tras la inhibición de la expresión de miR-15b-5p, las células RCC tuvieron una proliferación atenuada, un aumento de la apoptosis y una migración e invasión atenuadas. has-miR-15b-5p-WEE1, has- miR-15b-5p-EIF4E, has-miR-15b-5p-PPP2R1B pueden ser tres posibles vías reguladoras en ccRCC. miR-15b-5p se expresa altamente en tejidos cancerosos de pacientes con ccRCC. Puede promover la proliferación, inhibir la apoptosis y mejorar la migración celular y la invasión de células RCC. has-miR-15b-5p-WEE1, has- miR-15b-5p-EIF4E y has-miR-15b-5p-PPP2R1B pueden ser tres posibles vías reguladoras en ccRCC.

MicroARN circulantes y su potencialidad como futuros biomarcadores óseos / Circulating microRNAs and their potential use as future bone biomarkers / MicroRNAs circulantes e a sua potencialidade como futuros biomarcadores ósseos

Resumen El remodelamiento óseo es ejercido por la actividad de osteoblastos y osteoclastos y puede evaluarse por marcadores bioquímicos de formación y resorción ósea. Sin embargo, el nivel de los marcadores óseos está sometido a una enorme cantidad de variables y, además, carece o presenta escaso valor pronóstico. Los microARN (miARN) fueron recientemente estudiados como una alternativa potencial para ser utilizados como nuevos marcadores óseos. Los miARN son pequeñas moléculas de ARN no codificantes (15-25 nucleótidos) que, a través de la inhibición o degradación de ARN mensajeros, modifican una serie de funciones biológicas. Los miARN específicos de hueso ejercen funciones reguladoras sobre factores transcripcionales involucrados en la osteoblastogénesis y osteoclastogénesis, modificando el remodelamiento óseo. La mayoría de los miARN permanecen dentro de la célula, pero algunos son liberados a la circulación donde pueden ser dosados. Los miARN circulantes presentan gran estabilidad en fluidos biológicos, lo que los hace potenciales candidatos a ser utilizados como nuevos biomarcadores óseos. Cambios en el patrón normal de miARN circulantes específicos de hueso reflejarán modificaciones en el metabolismo óseo y señalan el posible inicio o progresión de enfermedades óseas, como la osteoporosis. Si bien es promisorio, el uso en la práctica clínica de los miARN específicos circulantes como nuevos biomarcadores óseos, ello implica primeramente cumplir con una serie de requisitos que permitan estandarizar las condiciones preanalíticas, analíticas y posanalíticas de estas moléculas. La presente revisión brinda información reciente sobre los estudios clínicos tendientes a determinar el posible uso de los miARN circulantes como nuevos biomarcadores óseos, ya que cuentan con elevada sensibilidad y especificidad diagnósticas, valor predictivo positivo y valor predictivo negativo.

Abstract Osteoblasts and osteoclasts activity determines the level of the bone remodelling process which can be assessed by biochemical markers of bone formation and resorption. However, bone marker levels are subject to a series of variables resand, furthermore, they lack or have little prognostic values. MicroRNAs (miRNAs) were recently studied as a potential alternative to be used as new bone biomarkers. The miRNAs are endogenous small noncoding RNA molecules (15-25 nucleotides) that regulate many biological functions by inhibiting or degrading specific messenger RNAs. Bone-specific miRNAs exert regulatory functions on key transcriptional factors involved in osteoblastogenesis and osteoclastogenesis, modifying the bone remodelling process. Most miRNAs remain within the cell, but some of them are released into circulation. Circulating miRNAs show great stability in biological fluids, which makes them excellent candidates to be used as new bone biomarkers. Modifications in the normal pattern of bone-specific circulating miRNA might reflect changes in bone metabolism, signalling the possible onset or progression of bone diseases, such as osteoporosis. Although promising, the use of specific circulating miRNAs as new bone biomarkers in clinical practice implies fulfilling a series of requirements that lead to standardising the pre-analytical, analytical and post-analytical conditions of these molecules. The present review gives an overview on the clinical studies related to the possible use of specific circulating miRNAs as new bone biomarkers.

Resumo A remodelação óssea é exercida pela atividade dos osteoblastos e osteoclastos e pode ser avaliada para a medição dos marcadores bioquímicos de formação e reabsorção óssea. No entanto, o nível dos marcadores ósseos está sujeito a grande quantidade de variáveis e, além disso, carece ou tem pouco valor prognóstico. Os microARN (miARN) foram estudados recentemente como uma alternativa potencial para serem utilizados como novos marcadores ósseos. Os MicroRNAs (miRNAs) são pequenas moléculas de RNA não codificantes (15-25 nucleotídeos) que, através da inibição ou degradação de RNA mensageiros modificam uma série de funções biológicas. Os miRNAs específicos de osso exercem funções reguladoras sobre fatores transcricionais envolvidos na osteoblastogênese e na osteoclastogênese, modificando o processo de remodelação óssea. A maioria dos miRNAs permanece dentro da célula, mas de RNA mensageiros alguns são liberados na circulação, onde podem ser determinados bioquimicamente. Os miRNAs circulantes apresentam grande estabilidade em fluidos biológicos, o que os torna excelentes candidatos para serem usados como novos biomarcadores ósseos. Mudanças no padrão normal de miRNA circulantes específicos do osso mostrarão mudanças no metabolismo ósseo, sinalizando o possível início ou progressão de doenças ósseas, como osteoporose. Embora promissor, o uso de miRNAs específicas circulantes na prática clínica como novos biomarcadores ósseos, implica primeiramente, atender uma série de requisitos que permitem padronizar as condições pré-analíticas, analíticas e pós-analíticas dessas moléculas. A presente revisão fornece informações recentes sobre estudos clínicos destinados a determinar o possível uso dos miRNAs circulantes como novos biomarcadores ósseos, visto que contam com elevada sensibilidade e especificidade diagnósticas, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo.

Expression of microRNAs miR-126, miR-133b and miR-221 associated with apoptosis in rats submitted to focal cerebral ischemia and physical exercise / Expresión de microRNAs miR-126, miR-133b y miR-221 asociados a apoptosis en ratas sometidas a isquemia cerebral focal y ejercicio físico

SUMMARY: Stroke is one of the main causes of death and disability worldwide. The great impact on the quality of life of the population and on the health system justifies that we seek relevant alternatives to reduce the incidence and improve the treatment and recovery of patients affected by this disease. Physical exercise appears as an important tool in this scenario, being already pointed out as a possible therapeutic approach for the prevention of non-contagious chronic diseases. In this context, biomarkers such as miRNAs that respond to physical exercise and are directly related to several epigenetic mechanisms appear. Therefore, explaining the molecular mechanisms involved during physical exercise will lead to a better understanding of each stimulus and the dose to be used to better respond to each situation, thus being a promising approach for the evolution of prescription and control of training and processes recovery from various diseases, including stroke. Forty-eight Wistar rats were used, divided into four experimental groups: control group, ischemia group, physical exercise group and exercise + ischemia group. Real-time PCR methodology was used to analyze the expression of miRNAs: miR-126, miR-133b and miR-221. In our study we observed a significant difference in the expression of miR- 221 between the control group and the others groups. However, microRNAs: miR-126 and miR-133b do not show significant differences in expression between groups.

El ictus es una de las principales causas de muerte y discapacidad en todo el mundo. El gran impacto en la calidad de vida de la población y en el sistema de salud justifica buscar alternativas pertinentes para reducir la incidencia y mejorar el tratamiento y recuperación de los pacientes afectados por esta enfermedad. El ejercicio físico aparece como una herramienta importante en este escenario, siendo ya señalado como un posible abordaje terapéutico para la prevención de enfermedades crónicas no contagiosas. En este contexto, aparecen biomarcadores como los miRNAs que responden al ejercicio físico y están directamente relacionados con varios mecanismos epigenéticos. Por lo tanto, explicar los mecanismos moleculares involucrados durante el ejercicio físico conducirá a una mejor comprensión de cada estímulo y la dosis a utilizar para responder mejor a cada situación, siendo así un enfoque prometedor para la evolución de la prescripción, el control del entrenamiento y los procesos de recuperación de diversas enfermedades, incluido el accidente cerebrovascular. Se utilizaron cuarenta y ocho ratas Wistar, divididas en cuatro grupos experimentales: grupo control, grupo isquemia, grupo ejercicio físico y grupo ejercicio + isquemia. Se utilizó la metodología de PCR en tiempo real para analizar la expresión de miRNAs: miR-126, miR-133b y miR-221. En nuestro estudio observamos una diferencia significativa en la expresión de miR-221 entre el grupo control y los demás grupos. Sin embargo, los microARN: miR-126 y miR-133b no mostraron diferencias significativas en la expresión entre grupos.

MicroRNA-27b expression in rats submitted to physical exercise and experimental cerebral ischemia / Expresión de MicroRNA-27b en ratas sometidas a ejercicio físico e isquemia cerebral experimental

SUMMARY: Cerebral ischemia has not only a high mortality rate, which is the second leading cause of death worldwide, but is also responsible for severe disabilities in working age individuals, generating enormous public expending for treatment and rehabilitation of the affected individuals. The role of microRNAs in the pathophysiology of cerebral ischemia has been highlighted in current investigations. In addition, recent studies have also highlighted physical exercise as a possible protective factor both in the prevention and in the effects of cerebral ischemia, placing it as an important study resource. Thus, we investigated the role of physical exercise in experimental cerebral ischemia associated with the expression of microRNA-27b. 16 animals were used, divided into four experimental groups: Control, Physical Exercise, Cerebral Ischemia and Cerebral Ischemia associated with Physical Exercise. The real-time PCR methodology was used to analyze the expression of microRNA-27b. Although there were no statistically significant differences in the expression of microRNA-27b between the groups studied, the increased expression of microRNA-27b in the Physical Exercise group indicates its neuroprotective role in the pathophysiology of cerebral ischemia.

RESUMEN: La isquemia cerebral no solo tiene una alta tasa de mortalidad y es la segunda causa principal de muerte en todo el mundo, sino también es la causa de enfermedades invalidantes en personas en edad laboral, lo que genera un gasto público enorme para el tratamiento y la rehabilitación de las personas afectadas. El papel de los microARN en la fisiopatología de la isquemia cerebral se ha destacado en las investigaciones actuales. Además, estudios recientes también han destacado el ejercicio físico como un posible factor protector tanto en la prevención como en los efectos de la isquemia cerebral, situándolo como un importante recurso de estudio. Por lo tanto, investigamos el papel del ejercicio físico en la isquemia cerebral experimental asociada con la expresión del microARN-27b. Se utilizaron 16 animales, divididos en cuatro grupos experimentales: Control, Ejercicio Físico, Isquemia Cerebral e Isquemia Cerebral asociada al Ejercicio Físico. Se utili- zó la metodología de PCR en tiempo real para analizar la expresión de microARN-27b. Aunque no se observaron diferencias estadísticamente significativas en la expresión de microARN-27b entre los grupos estudiados, la mayor expresión de microARN-27b en el grupo de Ejercicio Físico indica su papel neuroprotector en la fisiopatología de la isquemia cerebral.

Evaluation of serum microRNA-30e-5p expression in systemic lupus erythematosus and its association with clinical manifestations: A cross-sectional study / Evaluación de la expresión del microARN-30e-5p sérico en el lupus eritematoso sistémico y su asociación con las manifestaciones clínicas: un estudio transversal

ABSTRACT Background: MicroRNAs (miRNAs) are non-coding RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally. Accumulating evidence indicates that the miR-30 family takes part in the development of multiple tissues and organs, and is a potential contributor to various dis eases, including autoimmune disorders such as systemic lupus erythematosus (SLE). The aim of this study was to evaluate the expression of miR-30e-5p, a member of the miR-30 fam ily, and investigate its potential relationship to clinical characteristics and possible disease activity in an Egyptian SLE cohort. Methods: Serum samples from 40 SLE patients and 37 age and gender matched healthy sub jects were tested for miR-30e-5p expression level using the Taqman quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction. Analysis was performed using the 2 - AACT method. Results: The mean age of the patients was 28.7 ± 7.9 years, with a mean disease duration of 6.4 ±5.3 years. The median fold change in serum miR-30e-5p among our SLE cohort was significantly higher 1.748 (0.223-20.485) compared to the control group 0.877 (0.058-3.522) (P = 0.02). Receiver operating characteristic curve analysis revealed that miR-30e-5p expres sion level can discriminate SLE patients from controls at a cut-off value >1.06 with the area under the curve (AUC) = 0.676 (95% CI: 0.559-0.794, P = 0.02), with 64.3% sensitivity and 61.5% specificity. There was no correlation between any of the demographic features, clinical manifestations (apart from serositis, P = 0.013) or disease activity and miR-30e-5p levels. Conclusion: Our study demonstrated elevated miR-30e-5p expression levels in serum sam ples of SLE patients. Apart from serositis, it was not associated with any other disease characteristics.

RESUMEN Antecedentes: Los microARN (miRNA) son ARN no codificantes que regulan la expresión de los genes después de la transcripción. Las pruebas acumuladas indican que la familia de miR-30 participa en el desarrollo de múltiples tejidos y órganos, y es un posible contribuyente a diversas enfermedades, incluidos los trastornos autoinmunes como el lupus eritematoso sistémico (LES). El objetivo de este estudio fue evaluar la expresión del miR-30e-5p, un miembro de la familia miR-30, e investigar su posible relación con las características clínicas y la posible actividad de la enfermedad en una cohorte egipcia de LES. Métodos: Se analizaron muestras de suero de 40 pacientes con LES y 37 sujetos sanos de edad y sexo similares para determinar el nivel de expresión de miR-30e-5p, utilizando la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa cuantitativa Taqman. El análisis se llevó a cabo empleando el método 2-AACT. Los resultados: La edad media de los pacientes fue de 28,7 ± 7,9 años, mientras que la duración media de la enfermedad fue de 6,4 ± 5,3 años. La mediana del cambio de pliegue del suero miR-30e-5p entre nuestra cohorte de LES fue significativamente mayor, 1,748 (0,223-20,485), en comparación con el grupo de control, 0,877 (0,058-3,522) (p = 0,02). El análisis de la curva característica de funcionamiento del receptor reveló que el nivel de expresión del miR-30e-5p puede discriminar a los pacientes con LES de los controles en un valor de corte > 1,06, con el área bajo la curva (AUC) = 0,676 (IC del 95%: 0,559-0,794; p = 0,02), una sensibilidad del 64,3% y una especificidad del 61,5%. No hubo asociación entre ninguna de las características demográficas, manifestaciones clínicas (aparte de la serositis, p = 0,013) o actividad de la enfermedad y los niveles de miR-30e-5p. Conclusión: Nuestro estudio demostró niveles elevados de expresión de miR-30e-5p en mues tras de suero de pacientes con LES. Aparte de la serositis, no se asoció con ninguna otra característica de la enfermedad.

Papel de los microARN en la patogénesis del cáncer de próstata / The role of microRNAs in the pathogenesis of prostate cancer

Resumen El cáncer de próstata es una enfermedad prevalente, generadora de gran morbimortalidad y reportada como la quinta causa de muerte a nivel mundial. Según las estimaciones de GLOBOCAN (Global Cancer Observatory por sus siglas en inglés) para el año 2018 se reportaron 1 276 106 casos nuevos a nivel mundial. Recientemente, surgen los microARN como una posible estrategia futura como biomarcadores, tanto para el diagnóstico como para el tratamiento de la enfermedad. Los microARN son pequeñas moléculas de ARN que cumplen un papel en la regulación de la expresión génica, por lo que la expresión variable de estas moléculas tiene una función importante en la patogénesis del cáncer de próstata. La revisión de la literatura en diferentes bases de datos permitió evidenciar su papel en la patogénesis del cáncer de próstata. Se sugiere que la expresión diferencial de estas moléculas biológicas podría ser de utilidad en la práctica clínica. En Colombia se encuentra en investigación su utilidad en diferentes enfermedades, por lo cual esta revisión de tema podría contribuir a futuras investigaciones.

Abstract Prostate cancer is a prevalent disease, with great morbidity and mortality, reported as the fifth leading cause of death worldwide. According to estimates for 2018 by GLOBOCAN (Global Cancer Observatory), 1 276 106 new cases of prostate cancer were reported worldwide. Identifying methods that allow an early diagnosis and treatment of the disease is necessary. MicroRNA are a possible future strategy as biomarkers for prostate cancer. These are small RNA molecules, in charge of regulating genetic expression. Their differential expression is relevant in the pathogenesis of prostate cancer. Currently, literature suggests the differential expression of these biological molecules could be a tool in prostate cancer, with clinical utility. In Colombia new research related to microRNA and prostate cancer is being conducted, which justifies the pertinence of this literature review and the contribution it can have on future research.

Surgimiento de los micro-RNA como biomarcadores potenciales en diversas enfermedades / Emergence of micro-RNAs as potential biomarkers in different diseases / Surgimento dos micro-RNA como bio-marcadores potenciais em diversas doenças

El objetivo de esta revisión es evidenciar el potencial de los micro-RNA (mi-RNA) como biomarcadores en diferentes enfermedades. Los mi-RNA son ácidos nucleicos de ≈ 22 nucleótidos que regulan la traducción de RNA mensajeros (mRNA) codificantes y producen una regulación postranscripcional de la expresión génica. La mayoría de ellos son altamente conservados y tienen una distribución tisular específica, de manera que juegan un papel importante como reguladores de la función celular y la fisiopatología de los diferentes órganos del cuerpo humano. Los mi-RNA surgen como candidatos para ser biomarcadores debido a que se han encontrado cambios en su expresión en diversas enfermedades (cáncer, daño hepático y cardiopatías), con alteración de sus niveles en plasma suero, orina y saliva. Sin embargo, aunque algunos presentan consistencia en su perfil de expresión, otros han sido reportados como posibles candidatos para más de una enfermedad, lo que limita su especificidad y su utilidad diagnóstica. Es pertinente hacer nuevos estudios que ahonden sobre su significado en procesos patológicos y sobre su papel como posibles biomarcadores.

The objective of this review is to evidence the potential of micro-RNAs (mi-RNAs) as possible diagnostic biomarkers in different diseases. Micro-RNAs are nucleic acids of 22 nucleotides that regulate the translation of coding messenger RNAs (mRNAs), and produce a post-transcriptional regulation of genetic expression. Most mi-RNAs are highly conserved and show a tissue-specific distribution; therefore, they play an important role in the regulation of cell function and the physiopathology of different organs. Micro-RNAs emerge as potential candidates for biomarkers due to the changes in their levels of expression in different situations (cancer, hepatic and cardiovascular diseases) and in fluids such as plasma, serum, urine and saliva. However, although some mi-RNAs have a consistent expression profile, others have been reported as possible biomarkers for more than one disease, thus limiting their specificity and usefulness as diagnostic tools. Further studies are important to define the significance of mi-RNAs in pathologic processes and their role as possible biomarkers.

O objetivo desta revisão é evidenciar o potencial dos micro-RNA (mi-RNA) como bio-marcadores em diferentes doenças. Os mi-RNA são ácidos nucleicos de ≈ 22 nucleótidos que regulam a tradução de RNA mensageiros (mRNA) codificantes e produzem uma regulação pós-transcripcional da expressão génica. A maioria desses são altamente conservados e tem uma distribuição tissular específica, de maneira que jogam um papel importante como reguladores da função celular e a fisiopatologia dos diferentes órgãos do corpo humano. Os mi-RNA surgem como candidatos para ser bio-marcadores devido a que se hão encontrado câmbios em sua expressão em diversas doenças (câncer, dano hepático e cardiopatias), com alteração de seus níveis em plasma, soro, urina e saliva. Embora, ainda alguns apresentam consistência em seu perfil de expressão, outros hão sido reportados como possíveis candidatos para mais de uma doença, o que limita sua especificidade e sua utilidade diagnóstica. É pertinente fazer novos estudos que abondem sobre seu significado em processos patológicos e sobre seu papel como possível bio-marcadores.

Ácidos ribonucleicos no codificantes: hacia la era de la medicina personalizada / Noncoding ribonucleic acids: stepping into the era of personalized medicine

Los ácidos ribonucleicos (ARN) son moléculas que clásicamente transmiten la información codificada en el núcleo celular para traducirse a proteínas con diversas funciones. Sin embargo, existe una gran variedad de ARN (microARN, miARN, LncARN, ácido ribonucleicono codificante) capaces de regular diferentes funciones y bloquear o activar la transcripción celular, pero que no tienen la capacidad de traducirse a proteínas. Estos ARN conocidos como no codificantes, fueron descubiertos en los últimos años y están asociadosa diferentes enfermedades tanto inmunológicas como neoplásicas de forma específica. Además, se plantean como una herramienta de utilidad diagnóstica con alta especificidad, por lo que se espera que revolucionen los métodos actualmente utilizados en elámbito médico.

The ribonucleic acids (RNA) are molecules classically involved in the transmission of theinformation encoded in the nucleus, which are translated to proteins with different functions.However, there is a great variety of RNA (microRNA, miRNA, LncRNA, non-coding-RNA) capable of regulating several cellular mechanisms and blocking or activating thetranscription, but they cannot be translated into proteins. These kind of RNA are known asnon-coding, they were recently discovered and they are related to different immunologicaland neoplastic diseases. Moreover, non-coding-RNAs could become a high specificitydiagnostic tool, so it is expected that they will improve the methods currently used inmedicine.

IDENTIFICACIÓN DE ELEMENTOS cisREGULATORIOS Y PREDICCIÓN BIOINFORMÁTICA DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN INVOLUCRADOS EN LA REGULACIÓN DE miARNs EN PLANTAS / Identification of cisregulatory Elements and Bioinformatic Prediction of Transcriptional Factors Involved in Regulation of miRNAs in Plants

Los microARNs (miARNs) son pequeños ARN no codificantes que juegan un papel importante en el control de la expresión génica a través de la degradación de ARNm complementarios a su secuencia. La expresión de los miARNs es dependiente de la ARN polimerasa II como la mayoría de genes que codifican para proteínas. La regulación de la expresión de miARNs está bajo el control coordinado y combinatorio de factores de transcripción (FT). En este trabajo, se realizó una aproximación bioinformática para identificar sitios de unión de FT, TFBS (del inglés Transcription Factors Binding Sites) en regiones promotoras de genes miRNAs en 17 especies vegetales y se analizó el papel de algunos FT en defensa contra bacterias. Se encontró que nueve de las plantas analizadas presentaban diferencias significativas entre la distribución de TFBS presentes en los promotores de los miRNAs cuando se compara con los presentes en los genes codificantes de proteínas. En varios de los promotores de los miRNAs de yuca que son inducidos en respuesta a la infección por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis se identificaron elementos de unión como CCA1, T-box y SORLREP3, los cuales se presentan también en los genes que codifican proteínas implicadas en respuestas al ciclo circadiano y a la luz, sugiriendo que estos procesos y las respuestas inmunes en plantas pueden ser coordinados. En conjunto este trabajo aporta luces sobre los posibles mecanismos transcripcionales del control de la expresión génica de los miARNs.

MicroRNAs (miRNAs) are a group of small non coding RNAs involved in the control of gene expression through the degradation of mRNAs in a sequence specific manner. miRNAs expression is dependent on RNA polymerase II as most of the coding protein genes. The regulation of miRNAs expression is under the coordinated and combinatorial control of transcription factors (TFs). A bionformatic approach was carried out to identify transcription factor binding sites (TFBS) in the promoter of miRNAs genes in 17 different plant species and the possible involvement of TF in antibacterial response was analyzed. In nine of the plants studied significant differences in TFBS distribution in the promoter of miRNAs were observed when compare to the promoter of protein coding genes. TFBS as CCA1, T-box y SORLREP3 were present on the promoters of the cassava miRNAs induced in response to the infection by the bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. These TFBS are also present in the promoter of genes coding for proteins involved in circadian rhythm and light responses, suggesting a crosstalk between these process and immune plant responses. Taken together, the results here described give insight about the transcriptional mechanisms involved in the expression of miRNAs.